Ubuntu主界面的选项设定

按网上版本,没能运行成功,主要是环境变量里路径设置错误,红字为更改的部分

Ubuntu主界面的选项设定

blatSrc35.zip下载地址:

 

对于下载好的源代码安装包blatSrc35.zip,需进行编译,安装过程如下:

在Ubuntu中有如下几个文件可以设置环境变量。

1.用unzip blatSrc35.zip 解压缩包;

/etc/profile:在登录时操作系统定制用户环境时使用的第一个文件,此文件为系统的每个用户设置环境信息。当用户第一次登录时,该文件被执行。

2.bash:cd blatSrc
进入blatSrc文件夹下(此后直到设置环境变量,都在blatSrc文件夹下操作);

/etc/environment:在登录时操作系统使用的第二个文件,系统在读取你自己的profile前,设置环境文件的环境变量。

3.bash:uname -a  查看linux系统类型,我的系统是x86_64 GUN/LINUX;

/etc/bashrc:为每一个运行bash shell的用户执行此文件。当bash
shell被打开时,该文件被读取。

4.bash:export MACHTYPE=x86_64 回车;

~/.profile:在登录时用到的第三个文件是.profile文件,每个用户都可使用该文件输入专用于自己使用的shell信息。当用户登录
时,该文件仅仅执行一次!默认情况下,他设置一些环境变量,执行用户的.bashrc文件。修改后使用.
.profile使生效,最好也是用source也执行一次.profile。

5.bash:mkdir -p ~/bin/x86_64 回车;

~/.bashrc:该文件包含专用于单个用户的bash
shell的bash信息,当登录时以及每次打开新的shell时,该文件被读取。修改后使用source
.bashrc 使生效。

6.bash:make 回车;

     通常设置环境变量有三种方法:

7.设置环境变量:主目录下(/home/2188) bash:vim .bashrc;

一、临时设置

8.按”i”,编辑文档,最后行输入:export PATH=/home/2188/bin/x86_64:$PATH,编辑完成后Esc,:,wq,回车;(如果输入export
PATH=/home/2188/bin:$PATH,运行时不能成功,还需加./blat才能运行)

执行 export PATH=/home/yan/share/usr/local/arm/3.4.1/bin:$PATH

9.bash:source .bashrc更新环境变量。

二、当前用户的全局设置

至此blat安装完毕 bash:blat *.fa **.fa 回车即以**.fa为 母库比对。

打开~/.bashrc,添加行:

export PATH=/home/yan/share/usr/local/arm/3.4.1/bin:$PATH

使生效:

source .bashrc 

三、所有用户的全局设置

发表评论

电子邮件地址不会被公开。 必填项已用*标注